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系所概況
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生物晶片實驗室

負責教授:胡光宇

 生物晶片實驗室簡報大綱

  • 生物晶片實驗室軟硬體設備
  • 生物晶片實驗室軟硬體設備
  • 生物晶片實驗室軟硬體設備

生物晶片實驗室成立目的

  •  本實驗室以生物晶片相關實驗為教學主題 
  •  生物晶片為高通量的基因功能分析技術,能平行探索大量基因的功能及其間的交互作用,提供基因體/蛋白質體之全貌 
  •  生資系為培養本系學生對此新興生物技術的專業能力,並有效銜接學生的生物資訊與分子生物的核心能力,於是成立生物晶片的教學實驗室 
  •  生物晶片依其所能偵測的基因表現的數目,可分為 
  •  探索型生物晶片 (數千至數萬個基因) 
  •  檢測型生物晶片 (數十至數百個基因)
  •  本實驗室以檢測型生物晶片的實作,讓學生模擬及熟悉各式晶片的操作原理,及其資料分析

生物晶片實驗室相關支援課程

  1.  生物晶片課程
  2. 晶片探針設計
    • 晶片點片製作 (DR. Fast Spot )
    • 生物樣本 total RNA 萃取 
    • mRNA 反轉 錄成 cDNA以及螢光標記 (DR. Chip DIY Kit)))_ ))『)))) 
    • 晶片雜交 (DR. Mini Oven )
    • 晶片影像擷取及 
    • 晶片資料分 
  3. 晶片結果驗證 (Real-Time PCR) 
  4. 專題製作課程
  5. 檢測型基因晶片之設計製作
  6. 基因快速診斷檢測
  7. 探索型微陣列晶片之資料分析
  8. 基因表現定量擴殖分析
  9. 遺傳分子標誌應用技術

 生物晶片實驗室軟硬體設備

  • 本實驗室以硬體上的手動點片機,小型雜交烘箱,即時定量聚合酶連鎖反應器等儀器形成一套完整的生物晶片教學平台,全力支援學生由實作中了解生物晶片之探針設計、點片製作、晶片雜交、結果驗證
  • 並結合各種開放軟體的教學與應用,如 RMAExpressTM4::MeV R::BioConductor、和 Cytoscape,培養學生對生物晶片的分析探勘能力,以及對基因體/蛋白質體的整合探索能力
  • 硬體設備
    • 晶宇手動點片機 (DR. Fast Spot )
    • 晶宇小型雜交烘箱 (DR. Mini Oven)
    • 即時定量聚合酶連鎖反應器 (Two-Color Real-Time PCR System)
  • 軟體設備
    • RMAExpress
    • TM4 Suite (SpotFinder, MADAM, MIDAS, MeV)
    • R::BioConductor
    • Cytoscape

 

  

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